Vol. 48, No. 1 JUNE 2022

ISSN 2383 - 5338

연구실 소개

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후성유전체학 연구실(EpiGenomics Lab)
김경동 교수
중앙대학교 생명공학대학 시스템생명공학과
kdkim0122@cau.ac.kr

[연구실 소개]

Epigenomics lab 후성유전체학 연구실은 3차원적 유전체 구조와 유전자 발현과의 연관성을 분석하고, 3차원적 유전체 구조형성에 관여하는 architectural protein 들의 작용 메커니즘을 연구합니다. NGS 기술을 기반으로 한 Hi-C 방법에 의해 원핵생물로부터 사람세포에 이르기까지 3차원(3D) 유전체의 구조가 분석되어 유전체는 핵 안에서 고차원적인 구조를 형성하고 있고, 유전체 구조가 유전자발현, 염색체분리, DNA 복제기전과 연관되어 있음이 알려져 있습니다. 본 연구실에서는 NGS기술과 현미경적 방법을 통해 핵심인자의 결핍이나 외부환경에 따른 유전체 구조의 시공간적인 변화 (4D Nucleome)를 측정함으로써 유전체구조의 조절기작과 유전체구조의 변화로 인한 세포내 영향에 대한 심층적인 연구를 수행합니다. 유전체구조형성을 위해 핵심적인 역할을 하는 genome organizer로 condensin, cohesin, mediator 등이 있는데, 분열성 효모의 genome organizer를 매개로 한 4D Nucleome을 규명하고 이를 고등생물에 적용하고자 합니다.

<실험실 대표 연구 요약>

[연구분야]

  • 1. 분열성효모와 휴먼시스템에서 3차원 유전체구조 및 기능분석 연구
  • 2. 3차원 유전체 구조를 매개하는 genome organizer 연구
  • 3. 마이크로바이옴 내 존재하는 미생물들의 상호작용에 따른 유전체 구조변화 분석
  • 4. Viral episome의 공간적 구조에 따른 유전자 발현조절 연구

[활용분야]

Condensin, Cohesin, Mediator와 같은 genome organizer는 효모부터 사람에게까지 진화적으로 잘 보존되어 있고 3D 유전체 구조와 유전자 발현 등에 핵심적인 역할을 담당함이 알려져 있습니다. 분열성효모 모델시스템에서 이들 genome organizer가 3D유전체 구조형성과정에서 어떠한 역할을 하는지 밝히고 이를 고등생물에 적용할 수 있을 것으로 기대합니다.

[지도교수 약력]

  • 2022.03-현재부교수, 중앙대 시스템생명공학과
  • 2019.03-2022.02조교수, 중앙대 시스템생명공학과
  • 2011.07-2019.02포닥/ 연구원, The Wistar Institute, Philadelphia, US
  • 2010.08-2011.07포닥, 서울대학교 생명과학부
  • 2003.03-2010.08박사, 서울대 생명과학부
  • 1996.03-2003.03학사, 경북대 미생물학과

[대표 업적]

  1. Kyoung-Dong Kim, Hideki Tanizawa, Alessandra De Leo, Olga Vladimirova, Andrew Kossenkov, Fang Lu, Louise C. Showe, Ken-ichi Noma, and Paul M. Lieberman (2020) Specifications of Host Chromosome Docking Sites for Latent Epstein-Barr Virus. Nat. Comm., 11(1):877
  2. Osamu Iwasaki, Hideki Tanizawa, Kyoung-Dong Kim, Andrew Kossenkov, Timothy Nacarelli, Sanki Tashiro, Sonali Majumdar, Louise C Showe, Rugang Zhang, Ken-ichi Noma (2019) Involvement of Condensin in Cellular Senescence Through Gene Regulation and compartmental reorganization. Nat. Comm., 10(1):5688
  3. Hideki Tanizawa, Kyoung-Dong Kim, Osamu Iwasaki, and Ken-ichi Noma (2017) Architectural alterations of the fission yeast genome during the cell cycle. Nat. Struct. Mol. Biol., 24(11): 965-976
  4. Kyoung-Dong Kim*, Hideki Tanizawa*, Osamu Iwasaki, and Ken-ichi Noma (2016) Transcription factors mediate condensin recruitment and global chromosomal organization in fission yeast. Nat. Genet., 48(10): 1242-1252 (*: co-first author)
  5. Osamu Iwasaki, Hideki Tanizawa, Kyoung-Dong Kim, Yuhki Yokoyama, Christopher J. Corcoran, Atsunari Tanaka, Emmanuel Skordalakes, Louise C. Showe, and Ken-ichi Noma (2015) Interaction between TBP and condensin drives the organization and faithful segregation of mitotic chromosomes. Mol Cell. 59:755-67

[연구실 구성원]

지도교수: 김경동
연구박사: 조수연
대학원생: 김지현, 안성호, 김호중, 박선주, 이재민

[연락처]